Protein–RNA interactions for Protein: Q4U4S6

Xirp2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp2Q4U4S6 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Xirp2Q4U4S6 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Xirp2Q4U4S6 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Xirp2Q4U4S6 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Xirp2Q4U4S6 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Xirp2Q4U4S6 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Xirp2Q4U4S6 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Xirp2Q4U4S6 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Xirp2Q4U4S6 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Xirp2Q4U4S6 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Xirp2Q4U4S6 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Xirp2Q4U4S6 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Xirp2Q4U4S6 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Xirp2Q4U4S6 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Xirp2Q4U4S6 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Xirp2Q4U4S6 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Xirp2Q4U4S6 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Xirp2Q4U4S6 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Xirp2Q4U4S6 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Xirp2Q4U4S6 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Xirp2Q4U4S6 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Xirp2Q4U4S6 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Xirp2Q4U4S6 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Xirp2Q4U4S6 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Xirp2Q4U4S6 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Xirp2Q4U4S6 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Xirp2Q4U4S6 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Xirp2Q4U4S6 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Xirp2Q4U4S6 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Xirp2Q4U4S6 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Xirp2Q4U4S6 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Xirp2Q4U4S6 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Xirp2Q4U4S6 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Xirp2Q4U4S6 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Xirp2Q4U4S6 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Xirp2Q4U4S6 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Xirp2Q4U4S6 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Xirp2Q4U4S6 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Xirp2Q4U4S6 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Xirp2Q4U4S6 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Xirp2Q4U4S6 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Xirp2Q4U4S6 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Xirp2Q4U4S6 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Xirp2Q4U4S6 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Xirp2Q4U4S6 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Xirp2Q4U4S6 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Xirp2Q4U4S6 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Xirp2Q4U4S6 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Xirp2Q4U4S6 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Xirp2Q4U4S6 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Xirp2Q4U4S6 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Xirp2Q4U4S6 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Xirp2Q4U4S6 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Xirp2Q4U4S6 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Xirp2Q4U4S6 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Xirp2Q4U4S6 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Xirp2Q4U4S6 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Xirp2Q4U4S6 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Xirp2Q4U4S6 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Xirp2Q4U4S6 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Xirp2Q4U4S6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Xirp2Q4U4S6 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Xirp2Q4U4S6 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Xirp2Q4U4S6 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Xirp2Q4U4S6 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Xirp2Q4U4S6 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Xirp2Q4U4S6 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Xirp2Q4U4S6 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Xirp2Q4U4S6 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Xirp2Q4U4S6 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Xirp2Q4U4S6 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Xirp2Q4U4S6 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Xirp2Q4U4S6 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Xirp2Q4U4S6 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Xirp2Q4U4S6 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Xirp2Q4U4S6 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Xirp2Q4U4S6 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Xirp2Q4U4S6 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Xirp2Q4U4S6 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Xirp2Q4U4S6 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Xirp2Q4U4S6 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Xirp2Q4U4S6 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Xirp2Q4U4S6 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Xirp2Q4U4S6 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Xirp2Q4U4S6 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Xirp2Q4U4S6 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Xirp2Q4U4S6 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Xirp2Q4U4S6 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Xirp2Q4U4S6 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Xirp2Q4U4S6 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Xirp2Q4U4S6 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Xirp2Q4U4S6 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Xirp2Q4U4S6 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Xirp2Q4U4S6 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Xirp2Q4U4S6 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Xirp2Q4U4S6 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Xirp2Q4U4S6 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Xirp2Q4U4S6 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Xirp2Q4U4S6 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Xirp2Q4U4S6 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms