Protein–RNA interactions for Protein: Q497V5

Srbd1, S1 RNA-binding domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srbd1Q497V5 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Srbd1Q497V5 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Srbd1Q497V5 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Srbd1Q497V5 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Srbd1Q497V5 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Srbd1Q497V5 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Srbd1Q497V5 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Srbd1Q497V5 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Srbd1Q497V5 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Srbd1Q497V5 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Srbd1Q497V5 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Srbd1Q497V5 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Srbd1Q497V5 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Srbd1Q497V5 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Srbd1Q497V5 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Srbd1Q497V5 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Srbd1Q497V5 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Srbd1Q497V5 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Srbd1Q497V5 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Srbd1Q497V5 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Srbd1Q497V5 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Srbd1Q497V5 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Srbd1Q497V5 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Srbd1Q497V5 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Srbd1Q497V5 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Srbd1Q497V5 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Srbd1Q497V5 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Srbd1Q497V5 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Srbd1Q497V5 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Srbd1Q497V5 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Srbd1Q497V5 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Srbd1Q497V5 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srbd1Q497V5 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srbd1Q497V5 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srbd1Q497V5 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srbd1Q497V5 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srbd1Q497V5 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srbd1Q497V5 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srbd1Q497V5 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srbd1Q497V5 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srbd1Q497V5 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srbd1Q497V5 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srbd1Q497V5 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srbd1Q497V5 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Srbd1Q497V5 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srbd1Q497V5 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srbd1Q497V5 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srbd1Q497V5 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srbd1Q497V5 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srbd1Q497V5 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srbd1Q497V5 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srbd1Q497V5 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srbd1Q497V5 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srbd1Q497V5 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srbd1Q497V5 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srbd1Q497V5 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srbd1Q497V5 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srbd1Q497V5 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Srbd1Q497V5 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srbd1Q497V5 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srbd1Q497V5 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srbd1Q497V5 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Srbd1Q497V5 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Srbd1Q497V5 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Srbd1Q497V5 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Srbd1Q497V5 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Srbd1Q497V5 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Srbd1Q497V5 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Srbd1Q497V5 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Srbd1Q497V5 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Srbd1Q497V5 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Srbd1Q497V5 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Srbd1Q497V5 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Srbd1Q497V5 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Srbd1Q497V5 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Srbd1Q497V5 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Srbd1Q497V5 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Srbd1Q497V5 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Srbd1Q497V5 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Srbd1Q497V5 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Srbd1Q497V5 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Srbd1Q497V5 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Srbd1Q497V5 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Srbd1Q497V5 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Srbd1Q497V5 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Srbd1Q497V5 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Srbd1Q497V5 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Srbd1Q497V5 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Srbd1Q497V5 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Srbd1Q497V5 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Srbd1Q497V5 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Srbd1Q497V5 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Srbd1Q497V5 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Srbd1Q497V5 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Srbd1Q497V5 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Srbd1Q497V5 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Srbd1Q497V5 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Srbd1Q497V5 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Srbd1Q497V5 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Srbd1Q497V5 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms