Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms