Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C1

Zmat1, Zinc finger matrin-type protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zmat1Q3V0C1 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zmat1Q3V0C1 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zmat1Q3V0C1 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zmat1Q3V0C1 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zmat1Q3V0C1 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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