Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZP4

Svip, Small VCP/p97-interacting protein, mousemouse

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Length 77 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvipQ3UZP4 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Srp54a-207ENSMUST00000110708 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Lingo1-206ENSMUST00000210032 3627 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Slc14a2-201ENSMUST00000025434 2793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Slc27a5-201ENSMUST00000032539 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 AC154186.1-201ENSMUST00000227711 1597 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Gm43112-201ENSMUST00000196665 3122 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Rbm8a-201ENSMUST00000048915 2608 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Zkscan6-201ENSMUST00000018491 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Cd300lg-202ENSMUST00000107163 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Gm19165-201ENSMUST00000204453 1982 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Cts7-201ENSMUST00000021892 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Gm45354-201ENSMUST00000199820 2557 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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