Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYG1

Ccdc160, Coiled-coil domain-containing protein 160, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc160Q3UYG1 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms