Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW12

Cnga4, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-4, mousemouse

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Length 575 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga4Q3UW12 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms