Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQ97

Gm5460, Predicted gene 5460, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5460Q3UQ97 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm5460Q3UQ97 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm5460Q3UQ97 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm5460Q3UQ97 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5460Q3UQ97 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5460Q3UQ97 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5460Q3UQ97 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5460Q3UQ97 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5460Q3UQ97 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5460Q3UQ97 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5460Q3UQ97 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5460Q3UQ97 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5460Q3UQ97 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5460Q3UQ97 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5460Q3UQ97 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5460Q3UQ97 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5460Q3UQ97 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5460Q3UQ97 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5460Q3UQ97 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5460Q3UQ97 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5460Q3UQ97 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5460Q3UQ97 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5460Q3UQ97 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5460Q3UQ97 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5460Q3UQ97 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5460Q3UQ97 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5460Q3UQ97 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5460Q3UQ97 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5460Q3UQ97 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5460Q3UQ97 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5460Q3UQ97 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5460Q3UQ97 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5460Q3UQ97 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5460Q3UQ97 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5460Q3UQ97 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5460Q3UQ97 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5460Q3UQ97 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5460Q3UQ97 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5460Q3UQ97 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5460Q3UQ97 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5460Q3UQ97 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5460Q3UQ97 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5460Q3UQ97 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5460Q3UQ97 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5460Q3UQ97 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5460Q3UQ97 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5460Q3UQ97 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5460Q3UQ97 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5460Q3UQ97 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5460Q3UQ97 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5460Q3UQ97 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5460Q3UQ97 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5460Q3UQ97 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5460Q3UQ97 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5460Q3UQ97 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5460Q3UQ97 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5460Q3UQ97 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5460Q3UQ97 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5460Q3UQ97 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5460Q3UQ97 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5460Q3UQ97 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5460Q3UQ97 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5460Q3UQ97 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5460Q3UQ97 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5460Q3UQ97 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5460Q3UQ97 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5460Q3UQ97 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5460Q3UQ97 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5460Q3UQ97 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5460Q3UQ97 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5460Q3UQ97 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5460Q3UQ97 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5460Q3UQ97 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5460Q3UQ97 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5460Q3UQ97 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5460Q3UQ97 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5460Q3UQ97 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5460Q3UQ97 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5460Q3UQ97 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5460Q3UQ97 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5460Q3UQ97 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5460Q3UQ97 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5460Q3UQ97 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5460Q3UQ97 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5460Q3UQ97 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5460Q3UQ97 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5460Q3UQ97 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5460Q3UQ97 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5460Q3UQ97 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5460Q3UQ97 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5460Q3UQ97 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5460Q3UQ97 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5460Q3UQ97 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5460Q3UQ97 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5460Q3UQ97 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5460Q3UQ97 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms