Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms