Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMG5

Lrch2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch2Q3UMG5 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrch2Q3UMG5 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrch2Q3UMG5 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrch2Q3UMG5 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrch2Q3UMG5 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrch2Q3UMG5 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrch2Q3UMG5 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrch2Q3UMG5 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrch2Q3UMG5 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrch2Q3UMG5 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrch2Q3UMG5 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrch2Q3UMG5 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrch2Q3UMG5 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrch2Q3UMG5 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrch2Q3UMG5 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrch2Q3UMG5 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrch2Q3UMG5 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrch2Q3UMG5 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Lrch2Q3UMG5 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Lrch2Q3UMG5 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrch2Q3UMG5 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrch2Q3UMG5 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrch2Q3UMG5 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrch2Q3UMG5 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrch2Q3UMG5 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrch2Q3UMG5 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrch2Q3UMG5 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrch2Q3UMG5 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrch2Q3UMG5 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrch2Q3UMG5 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrch2Q3UMG5 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrch2Q3UMG5 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrch2Q3UMG5 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrch2Q3UMG5 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrch2Q3UMG5 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrch2Q3UMG5 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrch2Q3UMG5 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrch2Q3UMG5 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrch2Q3UMG5 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrch2Q3UMG5 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrch2Q3UMG5 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrch2Q3UMG5 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrch2Q3UMG5 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrch2Q3UMG5 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrch2Q3UMG5 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrch2Q3UMG5 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrch2Q3UMG5 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrch2Q3UMG5 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrch2Q3UMG5 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrch2Q3UMG5 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrch2Q3UMG5 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrch2Q3UMG5 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrch2Q3UMG5 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrch2Q3UMG5 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrch2Q3UMG5 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrch2Q3UMG5 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrch2Q3UMG5 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrch2Q3UMG5 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrch2Q3UMG5 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrch2Q3UMG5 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrch2Q3UMG5 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrch2Q3UMG5 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrch2Q3UMG5 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrch2Q3UMG5 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrch2Q3UMG5 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrch2Q3UMG5 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrch2Q3UMG5 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrch2Q3UMG5 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrch2Q3UMG5 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrch2Q3UMG5 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrch2Q3UMG5 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrch2Q3UMG5 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrch2Q3UMG5 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrch2Q3UMG5 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrch2Q3UMG5 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrch2Q3UMG5 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrch2Q3UMG5 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrch2Q3UMG5 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrch2Q3UMG5 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrch2Q3UMG5 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrch2Q3UMG5 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrch2Q3UMG5 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrch2Q3UMG5 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrch2Q3UMG5 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrch2Q3UMG5 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrch2Q3UMG5 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrch2Q3UMG5 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrch2Q3UMG5 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrch2Q3UMG5 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrch2Q3UMG5 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrch2Q3UMG5 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrch2Q3UMG5 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrch2Q3UMG5 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrch2Q3UMG5 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrch2Q3UMG5 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrch2Q3UMG5 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrch2Q3UMG5 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrch2Q3UMG5 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrch2Q3UMG5 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrch2Q3UMG5 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms