Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc33Q3ULW6 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc33Q3ULW6 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc33Q3ULW6 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc33Q3ULW6 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc33Q3ULW6 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc33Q3ULW6 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc33Q3ULW6 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc33Q3ULW6 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc33Q3ULW6 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc33Q3ULW6 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc33Q3ULW6 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc33Q3ULW6 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc33Q3ULW6 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc33Q3ULW6 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc33Q3ULW6 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc33Q3ULW6 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc33Q3ULW6 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc33Q3ULW6 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc33Q3ULW6 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc33Q3ULW6 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc33Q3ULW6 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc33Q3ULW6 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc33Q3ULW6 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc33Q3ULW6 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc33Q3ULW6 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc33Q3ULW6 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc33Q3ULW6 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc33Q3ULW6 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc33Q3ULW6 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc33Q3ULW6 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc33Q3ULW6 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc33Q3ULW6 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc33Q3ULW6 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc33Q3ULW6 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc33Q3ULW6 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc33Q3ULW6 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc33Q3ULW6 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc33Q3ULW6 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc33Q3ULW6 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc33Q3ULW6 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc33Q3ULW6 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc33Q3ULW6 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc33Q3ULW6 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc33Q3ULW6 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc33Q3ULW6 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc33Q3ULW6 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc33Q3ULW6 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc33Q3ULW6 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc33Q3ULW6 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc33Q3ULW6 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc33Q3ULW6 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc33Q3ULW6 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc33Q3ULW6 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc33Q3ULW6 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc33Q3ULW6 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc33Q3ULW6 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc33Q3ULW6 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc33Q3ULW6 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc33Q3ULW6 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc33Q3ULW6 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc33Q3ULW6 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc33Q3ULW6 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc33Q3ULW6 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc33Q3ULW6 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc33Q3ULW6 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc33Q3ULW6 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc33Q3ULW6 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc33Q3ULW6 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc33Q3ULW6 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc33Q3ULW6 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc33Q3ULW6 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc33Q3ULW6 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc33Q3ULW6 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc33Q3ULW6 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc33Q3ULW6 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc33Q3ULW6 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc33Q3ULW6 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc33Q3ULW6 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc33Q3ULW6 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc33Q3ULW6 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc33Q3ULW6 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc33Q3ULW6 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc33Q3ULW6 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc33Q3ULW6 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc33Q3ULW6 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc33Q3ULW6 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc33Q3ULW6 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc33Q3ULW6 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc33Q3ULW6 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc33Q3ULW6 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc33Q3ULW6 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc33Q3ULW6 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc33Q3ULW6 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc33Q3ULW6 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc33Q3ULW6 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc33Q3ULW6 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc33Q3ULW6 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc33Q3ULW6 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc33Q3ULW6 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms