Protein–RNA interactions for Protein: Q3UK78

Pcgf5, Polycomb group RING finger protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf5Q3UK78 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms