Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHE1

Pitpnm3, Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 974 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitpnm3Q3UHE1 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pitpnm3Q3UHE1 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pitpnm3Q3UHE1 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pitpnm3Q3UHE1 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pitpnm3Q3UHE1 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pitpnm3Q3UHE1 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pitpnm3Q3UHE1 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pitpnm3Q3UHE1 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pitpnm3Q3UHE1 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pitpnm3Q3UHE1 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pitpnm3Q3UHE1 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms