Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Puf60Q3UEB3 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Puf60Q3UEB3 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Puf60Q3UEB3 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Puf60Q3UEB3 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Puf60Q3UEB3 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Puf60Q3UEB3 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Puf60Q3UEB3 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Puf60Q3UEB3 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Puf60Q3UEB3 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Puf60Q3UEB3 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Puf60Q3UEB3 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Puf60Q3UEB3 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Puf60Q3UEB3 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Puf60Q3UEB3 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Puf60Q3UEB3 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Puf60Q3UEB3 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Puf60Q3UEB3 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Puf60Q3UEB3 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Puf60Q3UEB3 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Puf60Q3UEB3 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Puf60Q3UEB3 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Puf60Q3UEB3 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Puf60Q3UEB3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Puf60Q3UEB3 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Puf60Q3UEB3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Puf60Q3UEB3 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms