Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD82

Parp8, Poly [ADP-ribose] polymerase 8, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp8Q3UD82 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Parp8Q3UD82 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Parp8Q3UD82 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Parp8Q3UD82 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Parp8Q3UD82 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Parp8Q3UD82 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Parp8Q3UD82 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Parp8Q3UD82 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Parp8Q3UD82 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Parp8Q3UD82 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Parp8Q3UD82 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Parp8Q3UD82 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Parp8Q3UD82 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Parp8Q3UD82 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Parp8Q3UD82 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Parp8Q3UD82 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Parp8Q3UD82 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Parp8Q3UD82 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Parp8Q3UD82 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Parp8Q3UD82 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Parp8Q3UD82 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Parp8Q3UD82 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Parp8Q3UD82 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Parp8Q3UD82 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Parp8Q3UD82 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Parp8Q3UD82 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Parp8Q3UD82 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Parp8Q3UD82 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Parp8Q3UD82 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Parp8Q3UD82 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Parp8Q3UD82 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Parp8Q3UD82 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Parp8Q3UD82 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Parp8Q3UD82 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Parp8Q3UD82 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Parp8Q3UD82 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Parp8Q3UD82 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Parp8Q3UD82 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Parp8Q3UD82 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Parp8Q3UD82 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Parp8Q3UD82 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Parp8Q3UD82 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Parp8Q3UD82 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Parp8Q3UD82 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Parp8Q3UD82 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Parp8Q3UD82 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Parp8Q3UD82 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Parp8Q3UD82 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Parp8Q3UD82 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Parp8Q3UD82 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Parp8Q3UD82 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Parp8Q3UD82 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Parp8Q3UD82 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Parp8Q3UD82 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Parp8Q3UD82 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Parp8Q3UD82 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Parp8Q3UD82 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Parp8Q3UD82 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Parp8Q3UD82 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Parp8Q3UD82 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Parp8Q3UD82 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Parp8Q3UD82 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Parp8Q3UD82 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Parp8Q3UD82 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Parp8Q3UD82 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Parp8Q3UD82 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Parp8Q3UD82 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Parp8Q3UD82 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Parp8Q3UD82 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Parp8Q3UD82 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Parp8Q3UD82 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Parp8Q3UD82 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Parp8Q3UD82 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Parp8Q3UD82 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Parp8Q3UD82 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Parp8Q3UD82 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Parp8Q3UD82 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Parp8Q3UD82 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Parp8Q3UD82 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Parp8Q3UD82 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Parp8Q3UD82 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Parp8Q3UD82 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Parp8Q3UD82 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Parp8Q3UD82 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Parp8Q3UD82 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Parp8Q3UD82 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Parp8Q3UD82 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Parp8Q3UD82 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Parp8Q3UD82 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Parp8Q3UD82 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Parp8Q3UD82 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Parp8Q3UD82 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Parp8Q3UD82 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Parp8Q3UD82 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Parp8Q3UD82 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Parp8Q3UD82 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Parp8Q3UD82 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Parp8Q3UD82 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Parp8Q3UD82 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Parp8Q3UD82 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms