Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms