Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Q3U6N9 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q3U6N9 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q3U6N9 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q3U6N9 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q3U6N9 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q3U6N9 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Q3U6N9 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q3U6N9 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Q3U6N9 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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