Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

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Length 472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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