Protein–RNA interactions for Protein: Q3U319

Rnf40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, mousemouse

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf40Q3U319 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Rnf40Q3U319 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf40Q3U319 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf40Q3U319 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Rnf40Q3U319 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf40Q3U319 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf40Q3U319 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf40Q3U319 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Rnf40Q3U319 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf40Q3U319 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf40Q3U319 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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Rnf40Q3U319 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf40Q3U319 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf40Q3U319 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf40Q3U319 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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Rnf40Q3U319 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf40Q3U319 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
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Rnf40Q3U319 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf40Q3U319 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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Rnf40Q3U319 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf40Q3U319 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf40Q3U319 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
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Rnf40Q3U319 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf40Q3U319 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
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Rnf40Q3U319 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rnf40Q3U319 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rnf40Q3U319 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf40Q3U319 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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Rnf40Q3U319 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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Rnf40Q3U319 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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Rnf40Q3U319 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf40Q3U319 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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Rnf40Q3U319 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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Rnf40Q3U319 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf40Q3U319 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf40Q3U319 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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Rnf40Q3U319 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf40Q3U319 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf40Q3U319 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf40Q3U319 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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Rnf40Q3U319 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf40Q3U319 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf40Q3U319 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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Rnf40Q3U319 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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Rnf40Q3U319 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf40Q3U319 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf40Q3U319 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf40Q3U319 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf40Q3U319 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf40Q3U319 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf40Q3U319 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf40Q3U319 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf40Q3U319 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf40Q3U319 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf40Q3U319 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf40Q3U319 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf40Q3U319 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf40Q3U319 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf40Q3U319 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf40Q3U319 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf40Q3U319 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf40Q3U319 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf40Q3U319 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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