Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2P1

Sec24a, Protein transport protein Sec24A, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec24aQ3U2P1 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec24aQ3U2P1 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec24aQ3U2P1 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec24aQ3U2P1 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec24aQ3U2P1 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec24aQ3U2P1 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec24aQ3U2P1 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sec24aQ3U2P1 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sec24aQ3U2P1 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sec24aQ3U2P1 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sec24aQ3U2P1 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sec24aQ3U2P1 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sec24aQ3U2P1 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sec24aQ3U2P1 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sec24aQ3U2P1 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sec24aQ3U2P1 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sec24aQ3U2P1 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sec24aQ3U2P1 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sec24aQ3U2P1 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sec24aQ3U2P1 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sec24aQ3U2P1 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sec24aQ3U2P1 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sec24aQ3U2P1 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sec24aQ3U2P1 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sec24aQ3U2P1 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sec24aQ3U2P1 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sec24aQ3U2P1 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sec24aQ3U2P1 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sec24aQ3U2P1 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sec24aQ3U2P1 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sec24aQ3U2P1 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sec24aQ3U2P1 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec24aQ3U2P1 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec24aQ3U2P1 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec24aQ3U2P1 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec24aQ3U2P1 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec24aQ3U2P1 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec24aQ3U2P1 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec24aQ3U2P1 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec24aQ3U2P1 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec24aQ3U2P1 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec24aQ3U2P1 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec24aQ3U2P1 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec24aQ3U2P1 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec24aQ3U2P1 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec24aQ3U2P1 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec24aQ3U2P1 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec24aQ3U2P1 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec24aQ3U2P1 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec24aQ3U2P1 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec24aQ3U2P1 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec24aQ3U2P1 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec24aQ3U2P1 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec24aQ3U2P1 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec24aQ3U2P1 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec24aQ3U2P1 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec24aQ3U2P1 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec24aQ3U2P1 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec24aQ3U2P1 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec24aQ3U2P1 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec24aQ3U2P1 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec24aQ3U2P1 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec24aQ3U2P1 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec24aQ3U2P1 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec24aQ3U2P1 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec24aQ3U2P1 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec24aQ3U2P1 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec24aQ3U2P1 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec24aQ3U2P1 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec24aQ3U2P1 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec24aQ3U2P1 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec24aQ3U2P1 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec24aQ3U2P1 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec24aQ3U2P1 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec24aQ3U2P1 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec24aQ3U2P1 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec24aQ3U2P1 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec24aQ3U2P1 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec24aQ3U2P1 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec24aQ3U2P1 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec24aQ3U2P1 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec24aQ3U2P1 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec24aQ3U2P1 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sec24aQ3U2P1 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sec24aQ3U2P1 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sec24aQ3U2P1 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sec24aQ3U2P1 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sec24aQ3U2P1 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sec24aQ3U2P1 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sec24aQ3U2P1 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sec24aQ3U2P1 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sec24aQ3U2P1 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sec24aQ3U2P1 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sec24aQ3U2P1 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sec24aQ3U2P1 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sec24aQ3U2P1 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sec24aQ3U2P1 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sec24aQ3U2P1 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sec24aQ3U2P1 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sec24aQ3U2P1 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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