Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms