Protein–RNA interactions for Protein: Q3U285

Lcorl, Ligand-dependent nuclear receptor corepressor-like protein, mousemouse

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Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorlQ3U285 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LcorlQ3U285 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LcorlQ3U285 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LcorlQ3U285 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LcorlQ3U285 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LcorlQ3U285 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LcorlQ3U285 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LcorlQ3U285 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LcorlQ3U285 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LcorlQ3U285 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LcorlQ3U285 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LcorlQ3U285 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LcorlQ3U285 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LcorlQ3U285 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LcorlQ3U285 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LcorlQ3U285 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LcorlQ3U285 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LcorlQ3U285 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LcorlQ3U285 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LcorlQ3U285 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LcorlQ3U285 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LcorlQ3U285 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LcorlQ3U285 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LcorlQ3U285 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LcorlQ3U285 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LcorlQ3U285 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LcorlQ3U285 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LcorlQ3U285 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LcorlQ3U285 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LcorlQ3U285 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LcorlQ3U285 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LcorlQ3U285 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LcorlQ3U285 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LcorlQ3U285 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LcorlQ3U285 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LcorlQ3U285 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LcorlQ3U285 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LcorlQ3U285 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LcorlQ3U285 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LcorlQ3U285 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LcorlQ3U285 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LcorlQ3U285 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LcorlQ3U285 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LcorlQ3U285 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LcorlQ3U285 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LcorlQ3U285 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LcorlQ3U285 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LcorlQ3U285 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LcorlQ3U285 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LcorlQ3U285 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LcorlQ3U285 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LcorlQ3U285 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LcorlQ3U285 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LcorlQ3U285 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LcorlQ3U285 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LcorlQ3U285 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LcorlQ3U285 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LcorlQ3U285 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LcorlQ3U285 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LcorlQ3U285 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LcorlQ3U285 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LcorlQ3U285 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LcorlQ3U285 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LcorlQ3U285 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LcorlQ3U285 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LcorlQ3U285 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LcorlQ3U285 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LcorlQ3U285 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LcorlQ3U285 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LcorlQ3U285 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LcorlQ3U285 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LcorlQ3U285 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LcorlQ3U285 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LcorlQ3U285 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LcorlQ3U285 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LcorlQ3U285 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LcorlQ3U285 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LcorlQ3U285 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LcorlQ3U285 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LcorlQ3U285 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LcorlQ3U285 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LcorlQ3U285 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LcorlQ3U285 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LcorlQ3U285 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LcorlQ3U285 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LcorlQ3U285 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LcorlQ3U285 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LcorlQ3U285 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LcorlQ3U285 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LcorlQ3U285 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LcorlQ3U285 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LcorlQ3U285 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LcorlQ3U285 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LcorlQ3U285 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LcorlQ3U285 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LcorlQ3U285 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LcorlQ3U285 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LcorlQ3U285 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LcorlQ3U285 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LcorlQ3U285 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms