Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1F9

Pag1, Phosphoprotein associated with glycosphingolipid-enriched microdomains 1, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pag1Q3U1F9 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pag1Q3U1F9 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pag1Q3U1F9 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pag1Q3U1F9 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pag1Q3U1F9 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pag1Q3U1F9 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pag1Q3U1F9 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pag1Q3U1F9 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pag1Q3U1F9 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pag1Q3U1F9 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pag1Q3U1F9 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pag1Q3U1F9 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pag1Q3U1F9 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pag1Q3U1F9 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pag1Q3U1F9 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pag1Q3U1F9 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pag1Q3U1F9 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pag1Q3U1F9 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pag1Q3U1F9 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pag1Q3U1F9 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pag1Q3U1F9 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pag1Q3U1F9 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pag1Q3U1F9 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pag1Q3U1F9 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pag1Q3U1F9 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms