Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVA9

Ccdc136, Coiled-coil domain-containing protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc136Q3TVA9 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc136Q3TVA9 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc136Q3TVA9 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc136Q3TVA9 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc136Q3TVA9 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc136Q3TVA9 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc136Q3TVA9 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc136Q3TVA9 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc136Q3TVA9 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc136Q3TVA9 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc136Q3TVA9 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc136Q3TVA9 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc136Q3TVA9 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc136Q3TVA9 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc136Q3TVA9 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc136Q3TVA9 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc136Q3TVA9 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc136Q3TVA9 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc136Q3TVA9 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc136Q3TVA9 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc136Q3TVA9 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc136Q3TVA9 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc136Q3TVA9 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc136Q3TVA9 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc136Q3TVA9 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc136Q3TVA9 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc136Q3TVA9 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc136Q3TVA9 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc136Q3TVA9 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Ccdc136Q3TVA9 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc136Q3TVA9 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc136Q3TVA9 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc136Q3TVA9 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc136Q3TVA9 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc136Q3TVA9 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc136Q3TVA9 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc136Q3TVA9 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc136Q3TVA9 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc136Q3TVA9 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc136Q3TVA9 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc136Q3TVA9 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc136Q3TVA9 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc136Q3TVA9 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc136Q3TVA9 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc136Q3TVA9 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc136Q3TVA9 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc136Q3TVA9 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc136Q3TVA9 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc136Q3TVA9 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc136Q3TVA9 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc136Q3TVA9 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc136Q3TVA9 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc136Q3TVA9 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc136Q3TVA9 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc136Q3TVA9 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc136Q3TVA9 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc136Q3TVA9 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc136Q3TVA9 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc136Q3TVA9 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc136Q3TVA9 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc136Q3TVA9 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc136Q3TVA9 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc136Q3TVA9 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc136Q3TVA9 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc136Q3TVA9 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc136Q3TVA9 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc136Q3TVA9 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc136Q3TVA9 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc136Q3TVA9 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc136Q3TVA9 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc136Q3TVA9 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc136Q3TVA9 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc136Q3TVA9 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc136Q3TVA9 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc136Q3TVA9 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc136Q3TVA9 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc136Q3TVA9 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc136Q3TVA9 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc136Q3TVA9 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc136Q3TVA9 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc136Q3TVA9 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc136Q3TVA9 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc136Q3TVA9 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc136Q3TVA9 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc136Q3TVA9 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc136Q3TVA9 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc136Q3TVA9 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc136Q3TVA9 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc136Q3TVA9 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc136Q3TVA9 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc136Q3TVA9 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc136Q3TVA9 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc136Q3TVA9 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc136Q3TVA9 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc136Q3TVA9 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc136Q3TVA9 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc136Q3TVA9 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc136Q3TVA9 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc136Q3TVA9 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc136Q3TVA9 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms