Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTY5

Krt2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt2Q3TTY5 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt2Q3TTY5 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt2Q3TTY5 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt2Q3TTY5 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt2Q3TTY5 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt2Q3TTY5 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt2Q3TTY5 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt2Q3TTY5 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt2Q3TTY5 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt2Q3TTY5 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt2Q3TTY5 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt2Q3TTY5 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt2Q3TTY5 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt2Q3TTY5 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt2Q3TTY5 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt2Q3TTY5 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt2Q3TTY5 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt2Q3TTY5 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt2Q3TTY5 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt2Q3TTY5 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt2Q3TTY5 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt2Q3TTY5 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt2Q3TTY5 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt2Q3TTY5 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt2Q3TTY5 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt2Q3TTY5 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt2Q3TTY5 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt2Q3TTY5 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt2Q3TTY5 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt2Q3TTY5 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt2Q3TTY5 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt2Q3TTY5 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt2Q3TTY5 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt2Q3TTY5 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt2Q3TTY5 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt2Q3TTY5 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt2Q3TTY5 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt2Q3TTY5 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt2Q3TTY5 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt2Q3TTY5 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt2Q3TTY5 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt2Q3TTY5 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt2Q3TTY5 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt2Q3TTY5 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt2Q3TTY5 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt2Q3TTY5 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt2Q3TTY5 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt2Q3TTY5 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt2Q3TTY5 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt2Q3TTY5 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt2Q3TTY5 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Krt2Q3TTY5 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Krt2Q3TTY5 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Krt2Q3TTY5 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Krt2Q3TTY5 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Krt2Q3TTY5 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Krt2Q3TTY5 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Krt2Q3TTY5 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Krt2Q3TTY5 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Krt2Q3TTY5 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt2Q3TTY5 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt2Q3TTY5 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt2Q3TTY5 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt2Q3TTY5 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt2Q3TTY5 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt2Q3TTY5 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt2Q3TTY5 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt2Q3TTY5 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt2Q3TTY5 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt2Q3TTY5 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt2Q3TTY5 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt2Q3TTY5 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt2Q3TTY5 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt2Q3TTY5 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt2Q3TTY5 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt2Q3TTY5 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt2Q3TTY5 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt2Q3TTY5 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt2Q3TTY5 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt2Q3TTY5 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt2Q3TTY5 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt2Q3TTY5 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt2Q3TTY5 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt2Q3TTY5 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt2Q3TTY5 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt2Q3TTY5 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt2Q3TTY5 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt2Q3TTY5 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt2Q3TTY5 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt2Q3TTY5 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt2Q3TTY5 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt2Q3TTY5 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt2Q3TTY5 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt2Q3TTY5 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt2Q3TTY5 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt2Q3TTY5 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt2Q3TTY5 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt2Q3TTY5 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt2Q3TTY5 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt2Q3TTY5 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms