Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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