Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTJ4

Uncharacterized protein C8orf48 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTJ4 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q3TTJ4 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q3TTJ4 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Q3TTJ4 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Q3TTJ4 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q3TTJ4 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q3TTJ4 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q3TTJ4 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Q3TTJ4 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Q3TTJ4 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q3TTJ4 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Q3TTJ4 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q3TTJ4 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q3TTJ4 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q3TTJ4 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q3TTJ4 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q3TTJ4 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q3TTJ4 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q3TTJ4 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q3TTJ4 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q3TTJ4 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q3TTJ4 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q3TTJ4 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q3TTJ4 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q3TTJ4 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q3TTJ4 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q3TTJ4 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q3TTJ4 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q3TTJ4 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q3TTJ4 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q3TTJ4 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q3TTJ4 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q3TTJ4 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q3TTJ4 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q3TTJ4 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q3TTJ4 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q3TTJ4 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q3TTJ4 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q3TTJ4 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q3TTJ4 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q3TTJ4 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q3TTJ4 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q3TTJ4 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q3TTJ4 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Q3TTJ4 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q3TTJ4 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q3TTJ4 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q3TTJ4 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q3TTJ4 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q3TTJ4 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q3TTJ4 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q3TTJ4 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q3TTJ4 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q3TTJ4 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q3TTJ4 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q3TTJ4 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q3TTJ4 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q3TTJ4 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q3TTJ4 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q3TTJ4 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q3TTJ4 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q3TTJ4 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q3TTJ4 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q3TTJ4 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q3TTJ4 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q3TTJ4 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q3TTJ4 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q3TTJ4 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms