Protein–RNA interactions for Protein: Q3TGF2

Fam107b, Protein FAM107B, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam107bQ3TGF2 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam107bQ3TGF2 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam107bQ3TGF2 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam107bQ3TGF2 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam107bQ3TGF2 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam107bQ3TGF2 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam107bQ3TGF2 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam107bQ3TGF2 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam107bQ3TGF2 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam107bQ3TGF2 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam107bQ3TGF2 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam107bQ3TGF2 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam107bQ3TGF2 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam107bQ3TGF2 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam107bQ3TGF2 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam107bQ3TGF2 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam107bQ3TGF2 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam107bQ3TGF2 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam107bQ3TGF2 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam107bQ3TGF2 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam107bQ3TGF2 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam107bQ3TGF2 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam107bQ3TGF2 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam107bQ3TGF2 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam107bQ3TGF2 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms