Protein–RNA interactions for Protein: Q3TDV8

Zfp444, Zinc finger protein 444, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp444Q3TDV8 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zfp444Q3TDV8 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zfp444Q3TDV8 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zfp444Q3TDV8 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zfp444Q3TDV8 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zfp444Q3TDV8 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Zfp444Q3TDV8 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zfp444Q3TDV8 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zfp444Q3TDV8 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zfp444Q3TDV8 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zfp444Q3TDV8 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zfp444Q3TDV8 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zfp444Q3TDV8 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zfp444Q3TDV8 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zfp444Q3TDV8 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zfp444Q3TDV8 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zfp444Q3TDV8 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zfp444Q3TDV8 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zfp444Q3TDV8 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zfp444Q3TDV8 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zfp444Q3TDV8 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zfp444Q3TDV8 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zfp444Q3TDV8 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zfp444Q3TDV8 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zfp444Q3TDV8 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zfp444Q3TDV8 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zfp444Q3TDV8 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zfp444Q3TDV8 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zfp444Q3TDV8 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zfp444Q3TDV8 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zfp444Q3TDV8 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Zfp444Q3TDV8 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zfp444Q3TDV8 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zfp444Q3TDV8 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zfp444Q3TDV8 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zfp444Q3TDV8 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zfp444Q3TDV8 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zfp444Q3TDV8 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zfp444Q3TDV8 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zfp444Q3TDV8 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zfp444Q3TDV8 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zfp444Q3TDV8 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zfp444Q3TDV8 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zfp444Q3TDV8 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zfp444Q3TDV8 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zfp444Q3TDV8 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zfp444Q3TDV8 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zfp444Q3TDV8 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zfp444Q3TDV8 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zfp444Q3TDV8 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zfp444Q3TDV8 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zfp444Q3TDV8 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zfp444Q3TDV8 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Zfp444Q3TDV8 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Zfp444Q3TDV8 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zfp444Q3TDV8 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zfp444Q3TDV8 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zfp444Q3TDV8 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zfp444Q3TDV8 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zfp444Q3TDV8 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zfp444Q3TDV8 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zfp444Q3TDV8 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zfp444Q3TDV8 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zfp444Q3TDV8 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zfp444Q3TDV8 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zfp444Q3TDV8 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zfp444Q3TDV8 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zfp444Q3TDV8 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zfp444Q3TDV8 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zfp444Q3TDV8 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zfp444Q3TDV8 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Zfp444Q3TDV8 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zfp444Q3TDV8 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zfp444Q3TDV8 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zfp444Q3TDV8 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zfp444Q3TDV8 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zfp444Q3TDV8 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zfp444Q3TDV8 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zfp444Q3TDV8 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zfp444Q3TDV8 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zfp444Q3TDV8 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zfp444Q3TDV8 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zfp444Q3TDV8 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zfp444Q3TDV8 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zfp444Q3TDV8 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zfp444Q3TDV8 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zfp444Q3TDV8 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zfp444Q3TDV8 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zfp444Q3TDV8 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zfp444Q3TDV8 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zfp444Q3TDV8 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zfp444Q3TDV8 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zfp444Q3TDV8 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zfp444Q3TDV8 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zfp444Q3TDV8 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zfp444Q3TDV8 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zfp444Q3TDV8 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zfp444Q3TDV8 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zfp444Q3TDV8 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zfp444Q3TDV8 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms