Protein–RNA interactions for Protein: Q3TC33

Ccdc127, Coiled-coil domain-containing protein 127, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc127Q3TC33 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms