Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNP5

V1rd19, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V1rd19Q3KNP5 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
V1rd19Q3KNP5 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
V1rd19Q3KNP5 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
V1rd19Q3KNP5 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
V1rd19Q3KNP5 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
V1rd19Q3KNP5 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
V1rd19Q3KNP5 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
V1rd19Q3KNP5 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
V1rd19Q3KNP5 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
V1rd19Q3KNP5 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
V1rd19Q3KNP5 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
V1rd19Q3KNP5 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
V1rd19Q3KNP5 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
V1rd19Q3KNP5 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
V1rd19Q3KNP5 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
V1rd19Q3KNP5 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
V1rd19Q3KNP5 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
V1rd19Q3KNP5 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
V1rd19Q3KNP5 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
V1rd19Q3KNP5 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
V1rd19Q3KNP5 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
V1rd19Q3KNP5 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
V1rd19Q3KNP5 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
V1rd19Q3KNP5 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
V1rd19Q3KNP5 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
V1rd19Q3KNP5 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
V1rd19Q3KNP5 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
V1rd19Q3KNP5 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
V1rd19Q3KNP5 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
V1rd19Q3KNP5 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
V1rd19Q3KNP5 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
V1rd19Q3KNP5 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
V1rd19Q3KNP5 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
V1rd19Q3KNP5 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
V1rd19Q3KNP5 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
V1rd19Q3KNP5 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
V1rd19Q3KNP5 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
V1rd19Q3KNP5 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
V1rd19Q3KNP5 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
V1rd19Q3KNP5 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
V1rd19Q3KNP5 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
V1rd19Q3KNP5 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
V1rd19Q3KNP5 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
V1rd19Q3KNP5 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
V1rd19Q3KNP5 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
V1rd19Q3KNP5 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
V1rd19Q3KNP5 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
V1rd19Q3KNP5 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
V1rd19Q3KNP5 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
V1rd19Q3KNP5 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
V1rd19Q3KNP5 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
V1rd19Q3KNP5 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
V1rd19Q3KNP5 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
V1rd19Q3KNP5 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
V1rd19Q3KNP5 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
V1rd19Q3KNP5 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
V1rd19Q3KNP5 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
V1rd19Q3KNP5 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
V1rd19Q3KNP5 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
V1rd19Q3KNP5 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
V1rd19Q3KNP5 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
V1rd19Q3KNP5 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
V1rd19Q3KNP5 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
V1rd19Q3KNP5 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
V1rd19Q3KNP5 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
V1rd19Q3KNP5 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
V1rd19Q3KNP5 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
V1rd19Q3KNP5 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
V1rd19Q3KNP5 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
V1rd19Q3KNP5 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
V1rd19Q3KNP5 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
V1rd19Q3KNP5 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
V1rd19Q3KNP5 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
V1rd19Q3KNP5 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
V1rd19Q3KNP5 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
V1rd19Q3KNP5 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
V1rd19Q3KNP5 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
V1rd19Q3KNP5 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
V1rd19Q3KNP5 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
V1rd19Q3KNP5 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
V1rd19Q3KNP5 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
V1rd19Q3KNP5 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
V1rd19Q3KNP5 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
V1rd19Q3KNP5 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
V1rd19Q3KNP5 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
V1rd19Q3KNP5 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
V1rd19Q3KNP5 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
V1rd19Q3KNP5 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
V1rd19Q3KNP5 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
V1rd19Q3KNP5 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
V1rd19Q3KNP5 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
V1rd19Q3KNP5 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
V1rd19Q3KNP5 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
V1rd19Q3KNP5 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
V1rd19Q3KNP5 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
V1rd19Q3KNP5 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
V1rd19Q3KNP5 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
V1rd19Q3KNP5 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
V1rd19Q3KNP5 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
V1rd19Q3KNP5 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms