Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNL4

UPF0728 protein C10orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3KNL4 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3KNL4 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3KNL4 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3KNL4 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3KNL4 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3KNL4 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3KNL4 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3KNL4 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3KNL4 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3KNL4 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3KNL4 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3KNL4 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3KNL4 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3KNL4 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3KNL4 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3KNL4 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3KNL4 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3KNL4 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3KNL4 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3KNL4 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3KNL4 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3KNL4 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3KNL4 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3KNL4 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3KNL4 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3KNL4 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3KNL4 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3KNL4 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3KNL4 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3KNL4 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3KNL4 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3KNL4 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3KNL4 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3KNL4 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3KNL4 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3KNL4 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3KNL4 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3KNL4 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3KNL4 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3KNL4 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3KNL4 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3KNL4 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3KNL4 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3KNL4 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3KNL4 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3KNL4 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3KNL4 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3KNL4 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3KNL4 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3KNL4 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3KNL4 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3KNL4 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q3KNL4 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q3KNL4 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q3KNL4 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q3KNL4 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q3KNL4 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q3KNL4 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q3KNL4 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q3KNL4 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q3KNL4 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q3KNL4 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q3KNL4 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q3KNL4 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q3KNL4 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q3KNL4 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q3KNL4 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q3KNL4 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q3KNL4 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q3KNL4 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q3KNL4 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Q3KNL4 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q3KNL4 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q3KNL4 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q3KNL4 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q3KNL4 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q3KNL4 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q3KNL4 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q3KNL4 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Q3KNL4 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q3KNL4 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q3KNL4 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q3KNL4 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q3KNL4 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q3KNL4 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Q3KNL4 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q3KNL4 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q3KNL4 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q3KNL4 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q3KNL4 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q3KNL4 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q3KNL4 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q3KNL4 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q3KNL4 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q3KNL4 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q3KNL4 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q3KNL4 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q3KNL4 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q3KNL4 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q3KNL4 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms