Protein–RNA interactions for Protein: Q31615

H2-T22, Histocompatibility 2, T region locus 22, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-T22Q31615 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-T22Q31615 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-T22Q31615 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-T22Q31615 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-T22Q31615 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-T22Q31615 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-T22Q31615 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-T22Q31615 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-T22Q31615 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-T22Q31615 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-T22Q31615 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-T22Q31615 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-T22Q31615 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-T22Q31615 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-T22Q31615 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-T22Q31615 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-T22Q31615 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-T22Q31615 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-T22Q31615 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-T22Q31615 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-T22Q31615 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-T22Q31615 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-T22Q31615 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-T22Q31615 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-T22Q31615 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-T22Q31615 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-T22Q31615 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-T22Q31615 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-T22Q31615 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-T22Q31615 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-T22Q31615 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-T22Q31615 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-T22Q31615 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-T22Q31615 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-T22Q31615 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-T22Q31615 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-T22Q31615 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-T22Q31615 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-T22Q31615 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-T22Q31615 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-T22Q31615 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-T22Q31615 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-T22Q31615 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-T22Q31615 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-T22Q31615 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-T22Q31615 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-T22Q31615 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-T22Q31615 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-T22Q31615 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-T22Q31615 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-T22Q31615 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-T22Q31615 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-T22Q31615 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-T22Q31615 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-T22Q31615 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-T22Q31615 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-T22Q31615 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-T22Q31615 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-T22Q31615 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-T22Q31615 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-T22Q31615 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-T22Q31615 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-T22Q31615 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-T22Q31615 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-T22Q31615 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-T22Q31615 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-T22Q31615 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-T22Q31615 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-T22Q31615 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-T22Q31615 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-T22Q31615 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-T22Q31615 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-T22Q31615 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-T22Q31615 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-T22Q31615 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-T22Q31615 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-T22Q31615 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-T22Q31615 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-T22Q31615 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-T22Q31615 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-T22Q31615 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-T22Q31615 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-T22Q31615 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-T22Q31615 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-T22Q31615 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-T22Q31615 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-T22Q31615 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-T22Q31615 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-T22Q31615 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-T22Q31615 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-T22Q31615 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-T22Q31615 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-T22Q31615 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-T22Q31615 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-T22Q31615 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-T22Q31615 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-T22Q31615 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-T22Q31615 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-T22Q31615 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-T22Q31615 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms