Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms