Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
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Rpusd2Q149F1 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms