Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE29

Samd12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd12Q0VE29 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Samd12Q0VE29 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Samd12Q0VE29 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Samd12Q0VE29 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Samd12Q0VE29 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Samd12Q0VE29 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Samd12Q0VE29 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Samd12Q0VE29 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Samd12Q0VE29 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Samd12Q0VE29 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Samd12Q0VE29 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Samd12Q0VE29 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Samd12Q0VE29 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Samd12Q0VE29 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Samd12Q0VE29 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Samd12Q0VE29 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Samd12Q0VE29 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Samd12Q0VE29 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Samd12Q0VE29 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Samd12Q0VE29 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Samd12Q0VE29 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Samd12Q0VE29 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Samd12Q0VE29 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Samd12Q0VE29 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Samd12Q0VE29 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Samd12Q0VE29 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Samd12Q0VE29 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Samd12Q0VE29 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Samd12Q0VE29 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Samd12Q0VE29 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Samd12Q0VE29 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Samd12Q0VE29 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Samd12Q0VE29 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Samd12Q0VE29 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Samd12Q0VE29 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Samd12Q0VE29 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Samd12Q0VE29 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Samd12Q0VE29 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Samd12Q0VE29 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Samd12Q0VE29 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Samd12Q0VE29 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Samd12Q0VE29 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Samd12Q0VE29 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Samd12Q0VE29 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Samd12Q0VE29 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Samd12Q0VE29 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Samd12Q0VE29 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Samd12Q0VE29 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Samd12Q0VE29 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Samd12Q0VE29 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Samd12Q0VE29 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Samd12Q0VE29 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Samd12Q0VE29 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Samd12Q0VE29 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Samd12Q0VE29 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Samd12Q0VE29 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Samd12Q0VE29 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Samd12Q0VE29 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Samd12Q0VE29 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Samd12Q0VE29 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Samd12Q0VE29 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Samd12Q0VE29 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Samd12Q0VE29 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Samd12Q0VE29 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Samd12Q0VE29 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Samd12Q0VE29 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Samd12Q0VE29 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Samd12Q0VE29 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Samd12Q0VE29 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Samd12Q0VE29 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Samd12Q0VE29 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Samd12Q0VE29 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Samd12Q0VE29 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Samd12Q0VE29 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Samd12Q0VE29 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Samd12Q0VE29 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Samd12Q0VE29 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Samd12Q0VE29 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Samd12Q0VE29 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Samd12Q0VE29 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Samd12Q0VE29 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Samd12Q0VE29 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Samd12Q0VE29 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Samd12Q0VE29 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Samd12Q0VE29 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Samd12Q0VE29 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Samd12Q0VE29 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Samd12Q0VE29 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Samd12Q0VE29 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Samd12Q0VE29 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Samd12Q0VE29 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Samd12Q0VE29 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Samd12Q0VE29 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Samd12Q0VE29 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Samd12Q0VE29 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Samd12Q0VE29 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Samd12Q0VE29 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Samd12Q0VE29 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Samd12Q0VE29 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Samd12Q0VE29 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms