Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5X1

Lrriq1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrriq1Q0P5X1 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lrriq1Q0P5X1 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lrriq1Q0P5X1 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lrriq1Q0P5X1 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lrriq1Q0P5X1 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lrriq1Q0P5X1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lrriq1Q0P5X1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lrriq1Q0P5X1 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lrriq1Q0P5X1 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lrriq1Q0P5X1 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Lrriq1Q0P5X1 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lrriq1Q0P5X1 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lrriq1Q0P5X1 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lrriq1Q0P5X1 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lrriq1Q0P5X1 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lrriq1Q0P5X1 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lrriq1Q0P5X1 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lrriq1Q0P5X1 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lrriq1Q0P5X1 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lrriq1Q0P5X1 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lrriq1Q0P5X1 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lrriq1Q0P5X1 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lrriq1Q0P5X1 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lrriq1Q0P5X1 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lrriq1Q0P5X1 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lrriq1Q0P5X1 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lrriq1Q0P5X1 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lrriq1Q0P5X1 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lrriq1Q0P5X1 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lrriq1Q0P5X1 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lrriq1Q0P5X1 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lrriq1Q0P5X1 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lrriq1Q0P5X1 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lrriq1Q0P5X1 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Lrriq1Q0P5X1 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Lrriq1Q0P5X1 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lrriq1Q0P5X1 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Lrriq1Q0P5X1 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Lrriq1Q0P5X1 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Lrriq1Q0P5X1 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Lrriq1Q0P5X1 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Lrriq1Q0P5X1 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Lrriq1Q0P5X1 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Lrriq1Q0P5X1 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Lrriq1Q0P5X1 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Lrriq1Q0P5X1 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Lrriq1Q0P5X1 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Lrriq1Q0P5X1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Lrriq1Q0P5X1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lrriq1Q0P5X1 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Lrriq1Q0P5X1 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Lrriq1Q0P5X1 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Lrriq1Q0P5X1 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lrriq1Q0P5X1 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lrriq1Q0P5X1 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lrriq1Q0P5X1 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lrriq1Q0P5X1 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lrriq1Q0P5X1 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lrriq1Q0P5X1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lrriq1Q0P5X1 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lrriq1Q0P5X1 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Lrriq1Q0P5X1 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Lrriq1Q0P5X1 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Lrriq1Q0P5X1 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lrriq1Q0P5X1 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lrriq1Q0P5X1 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lrriq1Q0P5X1 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Lrriq1Q0P5X1 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lrriq1Q0P5X1 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lrriq1Q0P5X1 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lrriq1Q0P5X1 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lrriq1Q0P5X1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lrriq1Q0P5X1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lrriq1Q0P5X1 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lrriq1Q0P5X1 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Lrriq1Q0P5X1 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Lrriq1Q0P5X1 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Lrriq1Q0P5X1 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lrriq1Q0P5X1 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lrriq1Q0P5X1 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lrriq1Q0P5X1 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lrriq1Q0P5X1 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lrriq1Q0P5X1 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Lrriq1Q0P5X1 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Lrriq1Q0P5X1 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lrriq1Q0P5X1 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Lrriq1Q0P5X1 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Lrriq1Q0P5X1 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Lrriq1Q0P5X1 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lrriq1Q0P5X1 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lrriq1Q0P5X1 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lrriq1Q0P5X1 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lrriq1Q0P5X1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lrriq1Q0P5X1 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Lrriq1Q0P5X1 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lrriq1Q0P5X1 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lrriq1Q0P5X1 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lrriq1Q0P5X1 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Lrriq1Q0P5X1 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Lrriq1Q0P5X1 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms