Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vps8Q0P5W1 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vps8Q0P5W1 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vps8Q0P5W1 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vps8Q0P5W1 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vps8Q0P5W1 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vps8Q0P5W1 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vps8Q0P5W1 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vps8Q0P5W1 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vps8Q0P5W1 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vps8Q0P5W1 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Vps8Q0P5W1 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Vps8Q0P5W1 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vps8Q0P5W1 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vps8Q0P5W1 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vps8Q0P5W1 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vps8Q0P5W1 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vps8Q0P5W1 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vps8Q0P5W1 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vps8Q0P5W1 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vps8Q0P5W1 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vps8Q0P5W1 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vps8Q0P5W1 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vps8Q0P5W1 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Vps8Q0P5W1 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Vps8Q0P5W1 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vps8Q0P5W1 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vps8Q0P5W1 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vps8Q0P5W1 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vps8Q0P5W1 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vps8Q0P5W1 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vps8Q0P5W1 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vps8Q0P5W1 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vps8Q0P5W1 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vps8Q0P5W1 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vps8Q0P5W1 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vps8Q0P5W1 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vps8Q0P5W1 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Vps8Q0P5W1 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vps8Q0P5W1 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vps8Q0P5W1 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vps8Q0P5W1 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Vps8Q0P5W1 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Vps8Q0P5W1 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vps8Q0P5W1 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vps8Q0P5W1 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vps8Q0P5W1 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vps8Q0P5W1 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vps8Q0P5W1 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vps8Q0P5W1 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vps8Q0P5W1 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vps8Q0P5W1 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vps8Q0P5W1 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vps8Q0P5W1 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vps8Q0P5W1 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vps8Q0P5W1 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vps8Q0P5W1 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vps8Q0P5W1 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vps8Q0P5W1 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vps8Q0P5W1 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vps8Q0P5W1 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vps8Q0P5W1 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vps8Q0P5W1 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vps8Q0P5W1 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Vps8Q0P5W1 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vps8Q0P5W1 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vps8Q0P5W1 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Vps8Q0P5W1 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Vps8Q0P5W1 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Vps8Q0P5W1 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vps8Q0P5W1 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vps8Q0P5W1 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vps8Q0P5W1 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vps8Q0P5W1 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vps8Q0P5W1 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vps8Q0P5W1 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vps8Q0P5W1 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vps8Q0P5W1 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vps8Q0P5W1 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vps8Q0P5W1 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vps8Q0P5W1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vps8Q0P5W1 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Vps8Q0P5W1 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps8Q0P5W1 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps8Q0P5W1 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps8Q0P5W1 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps8Q0P5W1 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps8Q0P5W1 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps8Q0P5W1 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps8Q0P5W1 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps8Q0P5W1 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps8Q0P5W1 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps8Q0P5W1 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps8Q0P5W1 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps8Q0P5W1 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps8Q0P5W1 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps8Q0P5W1 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps8Q0P5W1 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps8Q0P5W1 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps8Q0P5W1 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms