Protein–RNA interactions for Protein: Q0KK55

Kndc1, Protein very KIND, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kndc1Q0KK55 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Kndc1Q0KK55 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Kndc1Q0KK55 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Kndc1Q0KK55 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Kndc1Q0KK55 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Kndc1Q0KK55 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kndc1Q0KK55 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kndc1Q0KK55 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kndc1Q0KK55 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Kndc1Q0KK55 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kndc1Q0KK55 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kndc1Q0KK55 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Kndc1Q0KK55 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kndc1Q0KK55 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kndc1Q0KK55 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Kndc1Q0KK55 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Kndc1Q0KK55 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kndc1Q0KK55 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kndc1Q0KK55 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Kndc1Q0KK55 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Kndc1Q0KK55 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kndc1Q0KK55 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kndc1Q0KK55 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Kndc1Q0KK55 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kndc1Q0KK55 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kndc1Q0KK55 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kndc1Q0KK55 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kndc1Q0KK55 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kndc1Q0KK55 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kndc1Q0KK55 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kndc1Q0KK55 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kndc1Q0KK55 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kndc1Q0KK55 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kndc1Q0KK55 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kndc1Q0KK55 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kndc1Q0KK55 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Kndc1Q0KK55 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kndc1Q0KK55 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Kndc1Q0KK55 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kndc1Q0KK55 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kndc1Q0KK55 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kndc1Q0KK55 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kndc1Q0KK55 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kndc1Q0KK55 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kndc1Q0KK55 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kndc1Q0KK55 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Kndc1Q0KK55 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kndc1Q0KK55 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kndc1Q0KK55 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kndc1Q0KK55 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kndc1Q0KK55 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kndc1Q0KK55 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kndc1Q0KK55 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kndc1Q0KK55 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kndc1Q0KK55 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kndc1Q0KK55 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kndc1Q0KK55 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kndc1Q0KK55 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kndc1Q0KK55 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kndc1Q0KK55 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kndc1Q0KK55 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kndc1Q0KK55 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kndc1Q0KK55 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Kndc1Q0KK55 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kndc1Q0KK55 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kndc1Q0KK55 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kndc1Q0KK55 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kndc1Q0KK55 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kndc1Q0KK55 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kndc1Q0KK55 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kndc1Q0KK55 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Kndc1Q0KK55 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kndc1Q0KK55 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kndc1Q0KK55 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kndc1Q0KK55 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kndc1Q0KK55 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kndc1Q0KK55 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kndc1Q0KK55 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kndc1Q0KK55 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Kndc1Q0KK55 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kndc1Q0KK55 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kndc1Q0KK55 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kndc1Q0KK55 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kndc1Q0KK55 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kndc1Q0KK55 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kndc1Q0KK55 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kndc1Q0KK55 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kndc1Q0KK55 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kndc1Q0KK55 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kndc1Q0KK55 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kndc1Q0KK55 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Kndc1Q0KK55 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kndc1Q0KK55 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kndc1Q0KK55 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kndc1Q0KK55 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kndc1Q0KK55 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kndc1Q0KK55 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kndc1Q0KK55 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kndc1Q0KK55 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kndc1Q0KK55 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms