Protein–RNA interactions for Protein: Q09143

Slc7a1, High affinity cationic amino acid transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc7a1Q09143 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc7a1Q09143 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc7a1Q09143 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc7a1Q09143 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc7a1Q09143 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc7a1Q09143 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc7a1Q09143 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc7a1Q09143 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc7a1Q09143 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc7a1Q09143 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc7a1Q09143 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc7a1Q09143 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc7a1Q09143 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc7a1Q09143 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc7a1Q09143 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc7a1Q09143 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc7a1Q09143 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc7a1Q09143 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc7a1Q09143 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc7a1Q09143 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc7a1Q09143 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc7a1Q09143 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc7a1Q09143 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc7a1Q09143 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc7a1Q09143 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc7a1Q09143 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc7a1Q09143 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc7a1Q09143 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc7a1Q09143 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc7a1Q09143 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc7a1Q09143 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc7a1Q09143 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc7a1Q09143 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc7a1Q09143 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc7a1Q09143 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc7a1Q09143 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc7a1Q09143 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc7a1Q09143 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc7a1Q09143 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc7a1Q09143 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc7a1Q09143 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc7a1Q09143 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc7a1Q09143 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc7a1Q09143 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc7a1Q09143 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc7a1Q09143 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc7a1Q09143 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc7a1Q09143 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc7a1Q09143 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc7a1Q09143 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc7a1Q09143 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc7a1Q09143 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc7a1Q09143 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc7a1Q09143 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc7a1Q09143 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc7a1Q09143 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc7a1Q09143 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc7a1Q09143 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc7a1Q09143 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc7a1Q09143 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc7a1Q09143 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc7a1Q09143 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc7a1Q09143 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc7a1Q09143 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc7a1Q09143 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc7a1Q09143 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc7a1Q09143 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc7a1Q09143 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc7a1Q09143 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc7a1Q09143 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc7a1Q09143 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc7a1Q09143 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc7a1Q09143 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc7a1Q09143 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc7a1Q09143 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc7a1Q09143 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc7a1Q09143 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc7a1Q09143 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc7a1Q09143 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc7a1Q09143 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc7a1Q09143 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc7a1Q09143 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc7a1Q09143 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc7a1Q09143 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc7a1Q09143 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc7a1Q09143 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc7a1Q09143 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc7a1Q09143 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc7a1Q09143 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc7a1Q09143 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc7a1Q09143 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc7a1Q09143 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc7a1Q09143 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc7a1Q09143 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc7a1Q09143 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc7a1Q09143 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc7a1Q09143 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc7a1Q09143 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc7a1Q09143 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc7a1Q09143 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms