Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms