Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms