Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms