Protein–RNA interactions for Protein: Q05A13

Sdr16c6, Short-chain dehydrogenase/reductase family 16C member 6, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr16c6Q05A13 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sdr16c6Q05A13 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sdr16c6Q05A13 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sdr16c6Q05A13 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sdr16c6Q05A13 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sdr16c6Q05A13 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sdr16c6Q05A13 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sdr16c6Q05A13 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sdr16c6Q05A13 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sdr16c6Q05A13 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sdr16c6Q05A13 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sdr16c6Q05A13 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sdr16c6Q05A13 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sdr16c6Q05A13 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sdr16c6Q05A13 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sdr16c6Q05A13 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sdr16c6Q05A13 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sdr16c6Q05A13 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sdr16c6Q05A13 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sdr16c6Q05A13 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sdr16c6Q05A13 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sdr16c6Q05A13 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sdr16c6Q05A13 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sdr16c6Q05A13 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sdr16c6Q05A13 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sdr16c6Q05A13 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sdr16c6Q05A13 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sdr16c6Q05A13 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sdr16c6Q05A13 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sdr16c6Q05A13 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Sdr16c6Q05A13 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sdr16c6Q05A13 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sdr16c6Q05A13 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdr16c6Q05A13 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdr16c6Q05A13 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdr16c6Q05A13 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdr16c6Q05A13 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdr16c6Q05A13 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdr16c6Q05A13 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdr16c6Q05A13 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdr16c6Q05A13 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdr16c6Q05A13 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdr16c6Q05A13 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdr16c6Q05A13 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdr16c6Q05A13 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdr16c6Q05A13 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdr16c6Q05A13 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdr16c6Q05A13 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdr16c6Q05A13 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdr16c6Q05A13 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdr16c6Q05A13 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdr16c6Q05A13 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdr16c6Q05A13 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdr16c6Q05A13 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdr16c6Q05A13 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdr16c6Q05A13 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdr16c6Q05A13 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdr16c6Q05A13 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdr16c6Q05A13 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdr16c6Q05A13 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdr16c6Q05A13 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdr16c6Q05A13 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdr16c6Q05A13 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdr16c6Q05A13 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdr16c6Q05A13 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdr16c6Q05A13 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdr16c6Q05A13 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdr16c6Q05A13 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdr16c6Q05A13 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdr16c6Q05A13 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdr16c6Q05A13 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdr16c6Q05A13 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdr16c6Q05A13 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdr16c6Q05A13 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdr16c6Q05A13 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdr16c6Q05A13 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdr16c6Q05A13 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdr16c6Q05A13 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sdr16c6Q05A13 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sdr16c6Q05A13 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sdr16c6Q05A13 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sdr16c6Q05A13 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sdr16c6Q05A13 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sdr16c6Q05A13 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sdr16c6Q05A13 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sdr16c6Q05A13 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sdr16c6Q05A13 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sdr16c6Q05A13 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sdr16c6Q05A13 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sdr16c6Q05A13 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sdr16c6Q05A13 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sdr16c6Q05A13 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sdr16c6Q05A13 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sdr16c6Q05A13 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sdr16c6Q05A13 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sdr16c6Q05A13 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sdr16c6Q05A13 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sdr16c6Q05A13 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sdr16c6Q05A13 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sdr16c6Q05A13 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms