Protein–RNA interactions for Protein: Q05186

Rcn1, Reticulocalbin-1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcn1Q05186 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms