Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sox13Q04891 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sox13Q04891 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox13Q04891 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox13Q04891 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox13Q04891 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox13Q04891 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox13Q04891 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox13Q04891 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox13Q04891 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox13Q04891 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox13Q04891 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox13Q04891 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox13Q04891 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox13Q04891 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox13Q04891 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox13Q04891 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox13Q04891 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox13Q04891 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox13Q04891 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox13Q04891 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms