Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Cxcr5Q04683 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cxcr5Q04683 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cxcr5Q04683 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cxcr5Q04683 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cxcr5Q04683 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Cxcr5Q04683 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cxcr5Q04683 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cxcr5Q04683 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Cxcr5Q04683 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cxcr5Q04683 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cxcr5Q04683 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Cxcr5Q04683 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Cxcr5Q04683 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cxcr5Q04683 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Cxcr5Q04683 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Cxcr5Q04683 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Cxcr5Q04683 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Cxcr5Q04683 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms