Protein–RNA interactions for Protein: Q04519

Smpd1, Sphingomyelin phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd1Q04519 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 9330118I20Rik-201ENSMUST00000203390 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Gm16701-202ENSMUST00000180995 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Gm16140-201ENSMUST00000117191 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms