Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms