Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms